Apple Configurator を利用して CLOMO MDM 管理下へデバイスの登録をおこなう場合、設定途中に MDM サーバーのトラストアンカー証明書を追加する画面が表示されますが、MDM サーバーのトラストアンカー証明書は、設定画面上に自動的に表示される仕様です。
そのため、証明書を個別に取得する必要はありません。

上のような設定画面において、MDM サーバーのトラストアンカー証明書が自動的に一覧表示されます。
そのうち「*.clomo.com」を選択した状態で「次へ」を選択し、次の設定画面へ進んでください。